Aynı adlı video oyunu serisinden uyarlanan NiNoKuni, hayatı tehlikede olan çocukluk arkadaşları Kotona'yı kurtarmak için iki ayrı ama paralel dünya arasında seyahat etmek zorunda kalan lise akranları Yuu ve Haru'yu izliyor. Aşkla karmaşıklaşan bu büyülü macerada, üç genç nihai seçimi yapmakla görevlendirilecek.