Bir MSDF denizaltısı bir ABD nükleer denizaltısıyla çarpışır ve komutanı Shiro Kaieda da dahil olmak üzere gemideki 76 kişinin tamamı ezilir. Ancak mürettebat hayatta kalır. Kaza, MSDF denizaltısının mürettebatını Japon ve ABD hükümetleri tarafından gizlice inşa edilen bir nükleer denizaltı olan Seabat'a bindirmek için uydurulmuş bir hikâyedir. Ancak Kaieda Seabat'ı nükleer füzelerle yükler ve aniden isyan ederek kaçar.