Lisede matematik dehası ve karate kara kuşağı olan K.C. Cooper, ailesinin casus olduğunu, onu gizli bir devlet kurumu olan The Organization'da kendilerine katılması için işe aldıklarında öğrenir. Artık emrinde en yeni casus aletleri olsa da, K.C.'nin casusluk hakkında öğrenmesi gereken çok şey vardır, buna yeni işini en iyi arkadaşı Marisa'dan saklamak da dahildir. K.C., ebeveynleri Craig ve Kira, küçük kardeşleri Ernie ve Judy (insansı bir robot) ile birlikte, dünyayı kurtarmak için yakın ve uzak gizli görevlerde bulunurken günlük aile hayatını dengelemeye çalışır.