5 çocuk cep telefonlarına gelen tuhaf mesajlarla kendilerini "Dijital Dünya "ya, "Digimon" adı verilen tuhaf yaratıklarla dolu garip bir dünyaya götüren bir trene yönlendirilir. Bu çocuklar oraya Cherubimon adlı kötü bir Digimon'un gezegeni tüm sakinleriyle birlikte tamamen yok etmesini engellemek için gönderilmişlerdir. Bunu başarmak için 5 çocuk, kendilerini Efsanevi Savaşçı Digimon'a dönüştürecek olan "ruhlarını" bulmalıdır. Ne yazık ki Cherubimon, hizmetkârlarına çocukların görevi tamamlamalarını engellemelerini emretmiştir; sonunda çocuklar gezegeni kurtarmak için Cherubimon'un güçleriyle savaşmak zorunda kalacaklardır.