FC 60 yılında, insanlığın çoğu Dünya'nın yörüngesinde dönen uzay kolonilerinde yaşamaktadır. Koloniler üzerindeki hakimiyet, her dört yılda bir, her ulusun Gundam adı verilen dev bir robotla diğerleriyle savaşmak üzere tek bir temsilci gönderdiği büyük bir turnuva ile belirlenir. Domon Kashuu bu turnuvalardan birinde Neo-Japonya'yı temsil etmek için seçilir, ancak ulusunun zaferini sağlamaktan çok, Domon'un ebeveynlerinin ölümünden ve çok tehlikeli bir silah olan Dark Gundam veya Devil Gundam'ın ortadan kaybolmasından sorumlu tutulan kardeşini bulmak için savaşır.