2061 yılında Japonya birden fazla devletin işgali altındadır. Japonya da dahil olmak üzere dünya dört ticaret bloğunun egemenliği altında birleştirilmiştir. Tüm takımadalar artık çatışmaların ön cephesinde yer almaktadır. Japon halkı, sokaklarında AMAIM adı verilen insansı savaş makinelerinin devriye gezdiği, sürekli bir işgal ve baskı altında yaşamaktadır. Amō Shiiba adında içine kapanık genç bir çocuk, otonom yapay zeka Gai ile tesadüfen tanışır ve AMAIM Kenbu'yu ele geçirmesiyle Japonya'yı geri almaya çalışacağı bir hikaye başlar. Gashin Tezuka, babasının intikamını almak için AMAIM Ghost'u kullanan, Japon direnişinin 16 yaşındaki suskun ve açık sözlü bir üyesidir.