U.C. 0096. Char'ın İsyanı'ndan üç yıl sonra, Endüstriyel 7 adlı üretim kolonisinde yaşayan Banagher Links, kendisine Audrey Burne diyen gizemli bir kızla tanışır. Audrey, Vist Vakfı'nın Laplace'ın Kutusu'nu Kollular olarak bilinen Neo Zeon kalıntılarına teslim etmesini engellemeye çalıştığını iddia eder, bu da yeni bir savaşı tetikleyebilecek bir eylemdir ve Banagher ona yardım etmeye karar verir. Ancak koloni, Sleeves ve devri durdurmak için gelen Dünya Federasyonu Güçleri arasında çatışmaların patlak vermesiyle bir savaş alanına dönüşür...