Paddington, artık Emekli Ayılar Evi'nde yaşayan sevgili Lucy Teyzesini ziyaret etmek için Peru'ya gider. Brown Ailesi'nin yanında, bir gizem onları Amazon yağmur ormanlarında ve Peru'nun dağ zirvelerinde beklenmedik bir yolculuğa sürüklediğinde heyecan verici bir macera başlar.