Bay Kondüktör'ün Parlayan Zaman ile Thomas'ın adası arasında seyahat etmesini sağlayan sihirli altın tozu stoku kritik derecede azalmıştır. Ne yazık ki daha fazlasını nasıl elde edeceğini bilmiyor. Bu arada Thomas, kötü dizel motorların saldırılarını savuşturmaktadır. Daha fazla altın tozu elde etmek için Bay C'nin tembel kuzeni, yeni arkadaşı Lily ve asık suratlı büyükbabasının yanı sıra gizli motorun da yardımı gerekecektir.