Gyaos'un yeniden ortaya çıkmasıyla Gamera'nın insanlıkla olan bağı kopmuş, Asagi ile olan bağı da kopmuştur. Nagamine ve Asagi araştırırken, Ayana adında yetim bir kız Iris adını verdiği yeni bir yaratık keşfeder. Nagamine ve Asagi, ailesinin ölümünden sorumlu tuttuğu Gamera'dan intikamını almadan önce Ayana'ya ulaşmalıdır.