Devrimci Kız Utena TV serisinin gevşek bir yeniden anlatımında, Utena Tenjou Ohtori Akademisi'ne gelir, ancak hemen sınıf arkadaşı Anthy Himemiya'nın eli ve sözde sahip olduğu güç için bir dizi düelloya sürüklenir. Aynı zamanda Utena, düelloların ardındaki sırları biliyor gibi görünen çocukluk arkadaşı Touga Kiryuu ile yeniden bir araya gelir. Utena, Ohtori'yi yöneten güç onu ve yeni ve eski arkadaşlarını ele geçirmeden önce bu sırları kendisi keşfetmek zorundadır.