Jiro adında genç bir çocuk, annesini ve kız kardeşini evinde öldürülmüş olarak bulur. Yanlışlıkla suçlanan Jiro, köyünden kaçar ve Tenkai adında bir rahiple tanışır, rahip de ona Tarouza adında haydut bir ninjayı öldürtür. Bu görevi yerine getirdikten sonra Jiro, usta bir suikastçı olmak için eğitim alır. Yıllar sonra Jiro, yetim olduğunu ve gerçek babasının, bir Ainu kadınına aşık olunca görevini bırakana kadar Tenkai için çalışan Tarouza olduğunu öğrenir. Genç ninja, Shogunate'nin Kaptan Kidd'in kayıp hazinesini geri almak ve Japonya'yı bir kez daha dünyanın geri kalanından izole etmek için kullanmak olduğunu keşfeder. Tarouza'nın gizli tuttuğu ipuçlarını kullanan Jiro, kadın ninja Oyuki ve Sam adında bir köleyle birlikte, Tenkai'den intikam almak için kullanma umuduyla hazineyi aramak üzere Rusya ve Amerika'ya gider.