Tokyo'daki bir sanayi bölgesinde ortaya çıkan bir kaiju dalgası, Kaptan Gento ve Özel Kaiju Reaksiyon Müfrezesi'ni (SKaRD) amansız bir savaşa girmeye sevk eder. Ancak çabalarına rağmen bitmek bilmeyen kaiju saldırısı devam eder. Kaiju leşlerini araştıran ve canavarların geldiği sanayi bölgesinde fabrikaları bulunan gelişmiş bir kimya şirketi olan Necromass Co. ile bir bağlantısı olduğundan şüphelenen SKaRD, şirketin CEO'su ve ünlü kimyager Dr. Mabuse'ye koşar. Necromass Co.'nun araştırma tesisinde Dr. Mabuse, ölümsüzlüğe ulaşmanın eşiğindeki bir madde olan damudoksinin geliştirilmesini açıklar. Bu sırada, kendilerini "evrenin hükümdarı" olarak tanımlayan Uzaylı Damuno ortaya çıkar. Yok edilen tanklardan sızan damudoksin, kaiju leşlerinden örnekleri tüketip dev Gongilgan'ı, Şeytani Leş'i ortaya çıkarınca kaos başlar. Japonya'nın başkenti Tokyo'da geçen filmde Ultraman Blazar ve SKaRD dev kaijuya karşı bir hesaplaşmaya giriyor!