Bir ay üssü, okyanuslarda yaşayan sakinleri için okyanuslarını kullanmak üzere dünya gezegenini ele geçirmek isteyen Zigra'dan gelen bir uzay gemisi tarafından yok edilir. Tüm Japonya onu desteklerken Gamera bir kez daha insan ırkının yardımına koşmak zorundadır.