Michael Peña, sosyal hizmet görevlisi Nicolasa ve düğme fabrikasında çalışan Eleuterio Peña'nın oğlu olarak Chicago'da doğdu ve büyüdü. Ailesi aslen Meksikalıydı. Liseden mezun olduktan sonra Peter Bogdanovich'in Sevgili Hocamız 2 (1996) filmi için yapılan oyuncu seçmelerine katıldı ve sürpriz bir şekilde rol için yüzlerce genci geride bıraktı. Los Angeles'a taşındıktan sonra Peña, aralarında Star Maps, My Fellow Americans (1996) (Jack Lemmon ve James Garner ile birlikte), La Cucaracha (1998) (Austin Film Festivali'nde En İyi Film ödülünü kazandı), Bellyfruit (1999) ve Disney/Jerry Bruckheimer filmi 60 Saniye'nin (2000) de bulunduğu filmlerde arka arkaya roller aldı. Los Angeles'ta yaşayan Michael, grubuyla bas gitar çalmakta, golf oynamakta ve rahatlamak için boks yapmaktadır.