Joss Whedon beş kardeşin ortancasıdır - küçük kardeşleri Jed Whedon ve Zack Whedon'dur. Hem babası Tom Whedon hem de büyükbabası John Whedon başarılı televizyon yazarlarıydı. Joss'un annesi Lee Stearns bir tarih öğretmeniydi ve Lee Whedon adıyla romanlar da yazıyordu. Whedon New York'ta büyüdü ve annesinin de öğretmenlik yaptığı Riverdale Country School'da eğitim gördü. Wesleyan Üniversitesi'nden sinema diplomasıyla mezun olmadan önce iki yıl İngiltere'deki Winchester College'a devam eden Whedon, Los Angeles'a taşındıktan sonra ilk TV yazarlığı işini "Roseanne" dizisinde aldı ve "Parenthood" dizisinin bir sezonunun senaryosunu yazmaya başladı. Daha sonra Vampir Avcısı Buffy (1992) olarak devam eden bir film senaryosu geliştirdi. Whedon filmin son halinden hiç memnun kalmadı - orijinal senaryosu kapsamlı bir şekilde yeniden yazıldı ve daha hafif bir tona büründürüldü. Bundan sonra Yaratık: Diriliş (1997) ve Oscar adayı olduğu Oyuncak Hikayesi (1995) gibi yüksek profilli yapımlarda senaryo yazarlığı yaptı. Ayrıca Hız Tuzağı (1994) başta olmak üzere çeşitli filmlerde 'senaryo doktoru' olarak çalıştı. 1997 yılında Whedon, Buffy karakterini The WB Network'te bir televizyon dizisinde yeniden canlandırma fırsatı buldu. Bu kez showrunner ve baş yapımcı olarak tüm sanatsal kontrolü elinde tutuyordu. Dizi, "Buffy the Vampire Slayer" popüler ve eleştirel bir hit oldu ve son ikisi UPN'de olmak üzere birkaç sezon boyunca devam etti. Whedon aynı zamanda başarılı bir spin-off dizisi olan "Angel"'ın da yapımcılığını üstlendi. Bilimkurgu televizyonuna bir adım atarak "Firefly" ile kült bir takipçi kitlesi geliştirdi, ancak uzun süre yayında kalmadı. DVD'de ve tekrar yayınlarda izleyici buldu ve Serenity adlı bir spin-off filmi çekildi: Diğer projeleri arasında çizgi roman yazarlığı, bilimkurgu draması "Dollhouse" ve Marvel gişe rekortmeni Yenilmezler'in (2012) senaryosu yer almaktadır.