Calista Kay Flockhart 11 Kasım 1964'te Freeport, Illinois'de doğdu. Annesi Kay (Honohan) bir okul öğretmeniydi ve babası Ronald Flockhart Kraft Foods Inc. için çalışıyordu. İrlanda, İskoç, Alman ve İngiliz kökenlere sahiptir. Calista adını büyük büyükannesinden alan Flockhart, oyunculuk eğitimi almak için New Jersey'deki Rutgers Üniversitesi'ne gitti. Üniversiteden sonra Cleveland, Louisville, Chicago ve Houston'daki bölgesel tiyatrolarda sekiz haftalık çalışma karşılığında 400 dolara çalıştı. 1994 yılında, Tennessee Williams'ın "The Glass Menagerie" oyununda "Laura" rolüyle ilk Broadway rolünü aldı ve bu rolüyle Tiyatro Dünyası ve Clarence Darwent Ödüllerine layık görüldü. Ayrıca Anton Çehov'un "The Three Sisters" adlı oyununda "Natasha" rolünde oynadı. Ally McBeal'den (1997) önce televizyona çok düşkün değildi, ancak HBO dizisi Lifestories'in 1992'deki bir bölümünde yer aldı: Families in Crisis (1992) adlı dizide yer aldı. Birçok filmde rol aldı, ancak bunların arasında Kuş Kafesi'nin (1996) yeniden çevrimi de var. Calista, Robin Williams'ın oğlunun nişanlısını canlandırdı. 1997'de Telling Lies in America'da (1997) Brad Renfro'nun saplantısının nesnesi olarak yer aldı.Calista, New York, Chicago ve başka yerlerde etkileyici bir sahne ve tiyatro repertuarı ile kendini kanıtladı. Broadway dışında "The Loop", "All for One", "Sophistry", "Wrong Turn at Lungfish", "Beside Herself" ve "Bovver Boys" yapımlarında çalıştı. Ayrıca Chicago'da "The Three Sisters" ve "Our Town" gibi New York dışı yapımlarda ve "Death Takes Williamstown Tiyatro Festivali'nde bir Tatil".