Güney Pasifik'te bir keşif gezisi, yerlilerin gizemli tanrı Gappa'ya taptığı tropik bir adaya düşer. Bir deprem bir yeraltı mağarasını açar ve içeride yavru bir sürüngen keşfedilir. Yerliler yabancıları yavruyu rahat bırakmaları konusunda uyarır ama onlar dinlemez ve yavruyu Japonya'daki bir hayvanat bahçesine götürürler. Kısa süre sonra, anne ve baba Gappa kaçırılan çocuklarını aramak için Tokyo'yu yakıp yıkmaya başlar.

Gappa, the Triphibian Monster

Japon Öz Savunma Gücü askerlerinden oluşan bir filo, kendilerini zaman içinde, rakip samuray klanlarının en yüce Shogun olmak için mücadele ettiği, ülkelerinin savaşan devletler dönemine ışınlanmış bulur.