Ortaokul öğrencisi Miaka, kütüphanede gizemli bir kitap bulana kadar Tokyo'da normal bir hayat yaşamaktadır ve arkadaşı Yui ile birlikte Dört Tanrı'nın Evreni'ne taşınırlar. Bu yeni evrene vardıklarında, kızlar hemen köle tacirlerinin saldırısına uğrar ve göz alıcı bir genç adam tarafından kurtarılırlar. Miaka'nın bakmadığı bir anda, Tamahome ve Yui ortadan kaybolur. Miaka'nın haberi olmadan, Yui gerçek dünyaya geri çekilmiştir. Miaka gizemli genç çocuğu bulmak ve arkadaşını kurtarmak için şehre doğru yola çıkarken, kütüphaneye döndüğünde tek yapabildiği okumaktır. Ancak Miaka'yı bekleyen şey iki kızın da beklediği şey değildir ve şimdi Miaka'nın kendi dünyasına dönmesinin tek yolu Suzaku Rahibesi olmak ve dünyalarını kurtarmaktır.