Endüstriyel Sanatlar Enstitüsü ve Marionette'de eğitim gördükten sonra 1950'lerde Prag Güzel Sanatlar Akademisi'nde eğitim gördü, Jan Svankmajer iş hayatına tiyatro yönetmeni, özellikle Maskeler Tiyatrosu ile birlikte ve Kara Tiyatro. Film yapımcılığını ilk kez Prag'daki Lanterna'nın çoklu ortam prodüksiyonlarına dahil olmak Magika Tiyatrosu. Kısa filmler çekmeye 1964 yılında başladı ve yirmi yılı aşkın bir süre aynı ortamda çalıştıktan sonra nihayet uzun zamandır arzuladığı uzun metrajlı bir film yapma hedefine ulaştı. Lewis Carroll'ın Alice Harikalar Diyarında (Neco z Alenky (1988)). Ayrıca çizimlerini, kolajlarını ve 'dokunsal heykellerini' sergiledi. geçici olarak yasaklandığı 1970'lerin ortalarında üretildi. Çek yetkililer tarafından film yapımcılığından men edildi. Kendisi Çek Cumhuriyeti'nde 1969'dan beri Prag Sürrealist Grubu üyesi.