Bir önceki Godzilla saldırısından sonra, onun hücrelerini toplamak için minyatür bir silahlanma yarışı başlar. Godzilla'nın olası geri dönüşünden endişe duyan Japon hükümeti, hücreleri yeni bir biyolojik silah olan ANEB'i (Anti-Nükleer Enerji Bakterisi) yaratmak için kullanır. Deneyleri yeni bir mutasyonla sonuçlanan genetikçi Genshiro Shiragami'den yardım isterler.

Godzilla vs. Biollante

9. sınıf öğrencileri Kazuo ve Kazumi, Japonya'nın küçük bir sahil kasabasındaki bir tapınakta takla atarlar. Doğaüstü bir müdahaleyle zihinleri ve bedenleri yer değiştirir ve sonuçta ortaokul hayatının baskılarından kurtulmaya çalıştıkları dokunaklı ve komik bir ergenlik komedisi ortaya çıkar.