2199 yılında, Gamilonların Dünya'yı istila etmeye başlamasından beş yıl sonra, gezegen uzaylıların bombalarıyla harap olmuştur. İnsanlığın kalıntıları ışınlanmış yüzeyden kaçmak için yeraltına kaçmıştır. Bir gün eski pilot Susumu Kodai, Iscandar gezegeninden gönderilen ve Dünya yüzeyindeki radyasyonu yok edebilecek bir cihazdan bahseden bir kapsül keşfeder. Dünya Savunma Gücü, Dünya'yı kurtarma umuduyla Iscandar'a 148.000 ışık yılı sürecek bir yolculuk yapmak üzere Yamato zırhlısını yeni bir tür itiş sistemiyle yeniden inşa eder. Bir yıl içinde radyasyon insanlığın geri kalanını yok olmaya sürükleyecektir.

Space Battleship Yamato

Yüksekokulda bir fotografçılık klubüne üye olan Tsukiko, daima ablası Tomie'den kendini aşağıda hisseder. Tomie, Tsukiko'nun gizlice aşık olduğu Toshio dahil, erkek öğrenciler arasında nefes kesici güzellikte ve popülerdir.  Birgün korkunç bir kaza sonucu kızkardeşinin önünde Tomie ölür. Tsukiko o geceden sonra geceleri kabus görmeye başlar. Bir yıl sonra Tsukiko ve ailesi, Tomie'nin 18.yaş gününde ölümünü anmak için bir doğum günü pastasının sessizce etrafında dururlar. Aniden kapılarında ürkütücü ses çalar. İnanılmaz bir durum bu Tomie dir. O geri dönmüştür. Anne ve babası gözyaşalrı içinde hoşgeldin derken, Tsukiko iç güdüsel olarak korku hissetmiştir. Sadece Tsukiko ile olduğu zaman Tomie yavaş yavaş gerçek yüzünü ortaya çıkarıyor. Şimdi Tsukiko kâbusu gerçeğe dönüşüyor ve korkunç günler başlar...