Ash ve arkadaşları Savaş Sınırı'ndan geçerken, görevi Manaphy'nin yumurtasını okyanus tabanındaki bir tapınağa götürmek olan bir Pokémon Korucusu ile karşılaşırlar. Ancak açgözlü bir korsan Manaphy'nin gücünün kendisine ait olmasını istemektedir.

Pokemon: Koruyucu Pokemon ve Deniz Tapınağı

Yüzyıllar önce, Kırmızılar ve Maviler adındaki iki grup arasında büyük bir savaş yaşandı. Bu savaş, The Wave Guiding Hero tarafından, Tree of the World Origin'in gücü kullanılarak durduruldu. Ash ve arkadaşları, kutlamaların devam ettiği Rota Kasabasına varırlar. Ash ve Pikachu, yılın kahramanını seçmek için bir pokémon maçına katılırlar. Uzun bir savaş sonunda Ash ve Pikachu yılın kahramanları seçilirler. Fakat kutlamalar arasında Mew belirir ve Pikachu'yu kapar. Ash ve arkadaşları Rukario ile birlikte onun peşine düşerler ve macera başlar...