Ancak Kerner Berlin'de büyüdü ve liseye orada devam etti. Liseden 1983 yılında mezun olduktan sonra işletme okudu. Ancak Kerner aslında medya sektörüne girmek istediği için 1986/87 yıllarında Sender Freies Berlin'de (SFB) staj yaptı. Burada 1992 yılına kadar SFB televizyonu için "Sport 3" ve "SFB Sportreport" programlarında spor muhabiri olarak çalıştı. Kerner 1992 yılında "SAT.1" ile bir sözleşme imzaladı ve burada "ran" ve "ranissimo" adlı spor programlarında sunucu ve yorumcu olarak çalıştı. Giderek daha popüler hale gelen spor muhabiri, 1994 Dünya Kupası sırasında "ran USA '94" adlı Dünya Kupası dergisinde yer aldı.1996'dan itibaren Kerner, spor gazeteciliği dışında bir sunucu olarak da yeteneklerini sergiledi: SAT.1'de iki yıl boyunca "Kerner" adıyla yayınlanan ilk günlük talk show programıyla yayına başladı. Kerner 1997 yılının sonlarına doğru bu özel kanaldan ikinci kamu kanalına geçti. ZDF'nin önde gelen isimlerinden biri haline gelen Kerner, "Current Sportstudio" ve yıllık "People" ve "Our Best" programlarını yönetti. Ocak 1998'de Kerner ZDF'de kendi haftalık talk show programı "Johannes B. Kerner" ile yayına başladı ve her Perşembe tanınmış kişilerin yanı sıra sıradan insanlarla da hayat hikayeleri hakkında konuştu.1998'den itibaren Kerner, Fransa'daki 1998 Dünya Kupası ve Belçika ve Hollanda'daki 2000 Avrupa Şampiyonası gibi büyük etkinlikler de dahil olmak üzere canlı futbol muhabiri olarak da görev aldı. ZDF ayrıca Sidney 2000 Olimpiyatları ile Japonya ve Güney Kore'deki 2002 Dünya Kupası yayınlarında da Johannes B. Kerner'den yararlandı. Kerner'in talk show programı, ortalama iki milyondan fazla izleyiciyle Almanya'nın en başarılı talk show programlarından biri haline geldi. 2002'nin başında haftalık yayın süresi Salı'dan Cuma'ya dört haftalık yayın süresine çıkarıldı. Kerner, gençlik dergisi "Bravo" tarafından 1996 ve 1999 yılları arasında dört kez "Otto" okuyucu' ödülüne layık görülmesi de dahil olmak üzere birçok ödül almıştır: iki kez gümüş ve iki kez bronz. 1996 yılında özel yayıncı "RTL" tarafından "Altın Aslan" ve "Sport-Bild" dergisi tarafından "En Popüler Spor Sunucusu" olarak ödüllendirilmiştir. Fransa'da düzenlenen 1998 Dünya Kupası sırasında yaptığı çalışmalarla "En İyi Yorumcu" ödülünü aldı. Haziran 2003 ortalarında ZDF'nin moderatörün sözleşmesini uzattığı ve böylece Kerner'in akşam programlarına ve diğer ZDF programlarına olan bağlılığına devam edebileceği öğrenildi. Kerner 2003 yılında "En İyi Talk Show Sunucusu" kategorisinde "Altın Kamera" ve "Altın Tüy" ödüllerini aldı. Ekim 2004'te "TV Total" program dergisi tarafından yapılan bir ankette Kerner, Alman televizyonlarındaki en popüler talk show sunucuları arasında birinci sırada yer aldı. "TV-Spielfilm" dergisinin okuyucuları da onu "2004 Yılının Konuşmacısı" seçti. Yine 2004 yılında Kerner, "Infotainment" için "Bambi" ile onurlandırıldı. Kerner, meslektaşı Steffen Seibert ile birlikte Aralık 2005'te bu kez Güneydoğu Asya'daki sel felaketinin kurbanları için büyük bağışlar toplanmasına yardımcı olan "Yardım etmek istiyoruz" programının gerçekleştirilmesi nedeniyle izleyici ödülü olan "Bambi" ödülünü aldı. Johannes B. Kerner, eski milli hokey oyuncusu Britta Becker ile evli ve iki çocuk babasıdır.