Frank Beyer okuldan sonra tiyatro eğitimi aldı. Kariyerine tiyatroda staj yaparak ve sahne dramaturgu olarak başladı. Daha sonra Prag'daki Film Okulu'na (FAMU) katıldı. Henüz öğrenciyken Kurt Maetzig'in asistanı oldu ve "Castles and Cats" (1957) gibi filmlere eşlik etti. Berthold Brecht'in Kafkas Tebeşir Dairesi'nden uyarlanan 1957 tarihli mezuniyet filmi "Two Mothers" ile ilk yönetmenlik denemesini de yaptı. Beyer, 1963 yapımı "Naked Among Wolves" ve 1974 yapımı "Jakob the Liar" gibi anti-faşist filmler yaptı. Ama aynı zamanda komedi filmleri üzerinde de çalıştı. 1963 tarihli "Karbid und Sauerampfer" ile ünlü bir komedi yönetmeni olarak çıkışını yaptı. Frank Beyer, Gerhard Klein, Joachim Kunert ve Konrad Wolf ile birlikte Doğu Almanya'nın en önemli film yapımcısı haline geldi, ancak çalışmaları siyasi tartışmalara da neden oldu. Eseri "Trace of the Stones" 1966 yılında gösterime girdi, ancak üç gün sonra anti-sosyalist içeriği nedeniyle sinema programından çıkarıldı. Manfred Krug'un oynadığı film 1989 yılına kadar bir daha sinemalarda gösterilmedi. Yönetmen, Doğu Almanya kültüründen sorumlu olanların fikirlerine defalarca meydan okudu ve bunu devlet film yapım şirketi DEFA'dan atılması izledi. Beyer daha sonra Dresden'deki tiyatro için işe alındı, ancak sürekli olarak devletin engellerine maruz kaldı. 1980'de Federal Almanya Cumhuriyeti'nde film yapma izni aldı. Başrol oyuncusu Manfred Krug Batı Almanya'ya kaçtığı için 1977 yapımı "The Hideaway" filminin gösterimi başlangıçta Doğu Almanya'da yasaklandı. Film ancak bir yıl sonra halka gösterilebildi. 1983 yılında Beyer'in "The Stay" adlı filmi Polonya'nın protestoları nedeniyle Berlinale'de gösterilmedi: Alman bir SS subayı Polonya'da tutsakken masum bir şekilde cinayetle suçlanır.Beyer'in son dönem film çalışmaları sosyal açıdan eleştirel ve politik temaları ele aldı. Wolfgang Menge'nin bir şablonuna dayanan Almanlar ve atom bombası hakkındaki 1991 tarihli "Masumiyetin Sonu" bu şekilde ortaya çıktı. 1992'de bir evlilik krizini konu alan "O ve O" bunu izledi. 1995 yılında, yeniden birleşme döneminde bir aile hakkında bir film olan "Nikolaikirche" çekildi. İki yıl sonra Beyer, Harald Juhnke ile birlikte Carl Zuckmayer"in "The Captain of Köpenick" filmini yeniden çekti. Yönetmen, Manfred Krug hakkında otobiyografik bilgileri "Abgehaut" film başlığı ile verdi. Diğer önemli filmleri arasında "Königskinder" (1962), "The Seven Affairs of Dona Juanita" (1973), "The Second Skin" (1981), "Bockshorn" (1983) ve "The Big Feast" (1992) sayılabilir.