Jonathan Carroll, New York'ta senarist Sidney Carroll ve oyuncu/şarkı sözü yazarı June Sillman'ın oğlu olarak dünyaya geldi. Suça itilmiş bir çocukken bir çocukluk arkadaşı polis tarafından vurularak öldürüldü. Bu noktada ailesi onu Connecticut'taki The Loomis School'a kaydettirdi. Rutgers Üniversitesi'ne devam etti ve buradan dereceyle mezun oldu. Yüksek lisans derecesini Virginia Üniversitesi'nden aldı. Daha sonra Hickory, Kuzey Carolina'daki North State Academy'de, St. Louis County Day School'da ve ardından Viyana, Avusturya'daki American International School'da İngilizce öğretmenliği yaptı. Beğenilen bir kısa öykü yazarı ve roman yazarı oldu.