Jong flütçü ve aktör olarak tanınmadan önce, 80'li yıllarda yakın arkadaşı Randy Santiago'nun geri vokalistiydi. Pek çok kişi Jong'un flüt çalarak kariyer yapmaya karar vermeden önce şarkıcı olmak istediğini bilmiyor. Jong'un şarkı söyleme yeteneği, Filipinler Üniversitesi'nde müzik eğitimi alırken ona destek oldu. Ulusal Müzik Sanatçısı olan babası merhum Ernani J. Cuenco, en küçük oğlunun eğitimine yardımcı olmuyordu. Jong'un UP yerine UST'ye kaydolmasını isteyen yaşlı Cuenco'ya karşı çıkmasının ardından baba-oğulun arası açılmıştı. Jong'un babası o zamanlar UST Müzik Koleji'nde profesördü ve annesi Magdalena da yine UST'de piyano eğitimi alıyordu ama Jong babasının gölgesinden kaçmaya kararlıydı. Bunu UST'ye giderek yapamayacağından emindi. İronik bir şekilde, UP'deki insanlar onun ünlü bestecinin oğlu olduğunu öğrendiğinde de aynı baskıyı hissetti. Ernani, oğlunun kendi başına başarılı olmak için duyduğu sarsılmaz arzuyu görünce Jong ile barışmaya karar verdi. Kısa süre sonra Jong, UP'de burs kazandı.MÜZİSYEN Jong karmaşık parçaları kolayca ezberledi ve yaşının ötesinde bir ritim duygusuna sahipti. Piyanoda ustalaştığında, babası onu başka bir müzik aletiyle tanıştırmaya karar verdi. O zamanlar 11 yaşında olan Jong'u bir enstrüman seçmesi için Filipinler Kültür Merkezi'ne götürdü. Çocuk flütü hemen sevdi ve 12 yaşında flüt dersleri almaya başladı ve günde iki ila üç saat pratik yapıyordu.Liseyi 1982'de Mandaluyong Lourdes Okulu'nda bitirdikten sonra, babasının isteklerine karşı gelerek müzikle ilgilenmeye karar veren Jong, UP Müzik Koleji'ne kaydoldu ve babasının profesör olduğu UST Müzik Konservatuarı'na kaydolmasını bekleyen babasının öfkesini daha da artırdı.Jong, bir zamanlar korktuğu piyano derslerinin bile şarkı ve reklam jingle'ları bestelemesinde kendisine yardımcı olduğunu itiraf ediyor. Flüt çalmak göz alıcı görünebilir, ancak reklam müziği bestelemek Jong'un hala ekmek teknesi. Milo, Jollibee, Enervon C ve Tanduay Rum gibi ürünlerin TV reklamlarına müzik sağlamıştır. Babası gibi Jong da film endüstrisi için müzik bestelemeyi denedi. Peque Gallaga'nın bir korku filmi olan "Aswang" ve 1999'da gösterime giren bir başka film olan tartışmalı 'Sutla'nın müziklerini yaptı.' Ayrıca önceki albümleri için bir dizi şarkı besteledi.Jong, OctoArts EMI International çatısı altındaki beş albümünden ikincisi olan ve 20.000'den fazla kopya satan ilk altın albümü "Nightwind" ile dikkatleri üzerine çekti. Ayrıca Temmuz 2000'de BMG Records Pilipinas altında "Imagine" başlıklı altıncı ticari sürümü olan bir albüm yayınladı. Jong'un reklamcılık ve konserlerle ilgilenmesi, ticari ve kurumsal müşterilerin ihtiyaçlarını karşılayan bir etkinlik yönetimi ve sanatçı koordinasyon şirketi olan Sound Advice Manila Production (şu anda Ernani M. Cuenco, Jr. Etkinlik Yönetimi ve Danışmanlığı olarak biliniyor) adlı kendi prodüksiyon ekibini kurmasına neden oldu. Smart Communications, Unilab, Globe telecoms, San Miguel Corporations ve Pagcor gibi müşteriler, etkinlikleri için Jong'a güvenmiştir.Jong'un müziği, flütünün sesiyle kendi müzik markasını yorumlayarak hem yerel hem de yurtdışında performans sergileme fırsatı verdi. Profesyonel olmadan önce, 1980 yılında CCP'de Genç Sanatçılar için Ulusal Müzik Yarışmasını (NAMCYA) kazandı. Profesyonel olarak Jong, hem AWIT hem de ALIW Ödülleri tarafından "En İyi Enstrümantal Performans" dalında iki kez aday gösterildi ve ardından 2002 yılında ALIW ödülleri tarafından "En İyi Enstrümantalist" ödülüne layık görüldü. Filipin Gençlik Orkestrası, Filipin Gençlik Senfonik Bandosu, çeşitli retro ve caz gruplarının bir üyesiydi ve ülkenin tanınmış profesyonel müzisyenler birliği olan Asosasyon ng Musikong Pilipino veya AMP'nin Başkanı ve Başkanıdır. Müzik endüstrisinin korsanlıkla ilgili sorunlar nedeniyle yavaşlamasıyla Jong kendini yeniden keşfetti ve oyunculukta şansını denedi. Çocukluk arkadaşı Gabby Concepcion'un hasta babasına bakmak için Amerika Birleşik Devletleri'nden eve dönmesi ve şov dünyasındaki kariyerine yeniden başlamasıyla çıkış yakaladı. Gabby'nin çekim günlerinden birinde, Jong'dan kendisini sette ziyaret etmesini istedi. Sohbet ederken, dizinin baş yapımcısı Gabby'ye dizide Gabby'nin en iyi arkadaşı olarak hareket edecek yeni bir karakter tanıtmaları gerektiğini söyledi. Gabby hemen Jong'u tanıttı ve tavsiye etti ve hemen işe alındı.Jong, ABS-CBN için çok sayıda "teleseryes" ve şovda yer aldı. Mütevazı başlangıcından "Dahil May Isang Ikaw" dizisinde Gabby'nin en iyi arkadaşı Nikos rolüne, "Green Rose" dizisinde Jericho Rosales'i darağacına gönderen alıngan avukat Atty. Fidel Santos karakterine kadar Jong, Maalala Mo Kaya (MMK), Growing Up, Mundo Man Ay Magunaw ve Hiyas dizilerinde rol alarak oyunculuk yeteneğini kanıtladı. Son çalışmaları arasında Anton Abueva rolüyle "Sana Bukas Pa Ang Kahapon", Prenses ve Ben, (Daniel Padilla'nın babası Edward dela Rosa rolüyle), Miguel Del Sol rolüyle Apoy sa Dagat, JC de Veyra'nın avukatı Atty. Manglapuz rolüyle "You're My Home" ve "And I Love You So" yer almaktadır. Jong, sinema ve televizyondaki oyunculuk başarıları listesine GMA7'deki konuk oyunculuklarını da ekledi, ancak çoğunlukla "gayri resmi" ana kanalı olan ABS-CBN için.HOST Jong, iyi arkadaşı John Lesaca GMA-7 için "A Little Night of Music" programının sunucularından biri olarak veda ettiğinde bir TV programı sunma fırsatı buldu. Aynı zamanda Wave 89.1 için "Tuesday Night Flight" adlı kendi radyo programını sunmuş ve pop istasyonu için serin ve yumuşak enstrümantal müzikler sunmuştur. Pagcor'un kendisinden çok konuşulan "Shower of Millions" oyunu da dahil olmak üzere Bingo oyunlarını sunmasını ve idare etmesini istemesiyle sunuculuk yeteneği test edilmiştir. Jong bugüne kadar bu oyunları yönetirken 50 Milyondan fazla ödül dağıttı. Ayrıca kurumsal lansmanlara ve turnuvalara da ev sahipliği yaptı.