Dünyanın dört bir yanındaki polis güçleri tarafından tutulan güvenlik kameralarını birbirine bağlayan bir deniz tesisi olan Pacific Buoy, Tokyo'daki Hachijojima Adası yakınlarındaki sularda inşa edildi ve dünyanın dört bir yanından mühendisleri tam ölçekli operasyon için bir araya getirdi. Yüz tanıma sistemi kullanılarak yeni bir teknoloji test ediliyordu. Bu arada, Conan ve diğer çocuk dedektifler, Sonoko'nun daveti üzerine balina izlemek için Hachijojima'ya gelmişlerdi. Daha sonra Conan, Subaru Okiya'dan (Shuichi Akai) bir Europol çalışanının Almanya'da siyah bir örgüt olan cin tarafından öldürüldüğü haberini alır. Rahatsız olan Conan, bir kadın mühendisin siyah bir örgüt tarafından kaçırıldığı Pasifik Şamandırası'na sızar. Ve Hachijojima'da kalan Haibara'nın üzerinde siyah bir gölge sürünür.

Dedektif Conan: Siyah Demir Denizaltı

Özel araştırmacı Kogoro, Tokyo Zirvesindeki devasa Okyanus tesisine bir patlama yapmakla suçlanıyor. Kogoro tutuklandı ve Conan ismini temizlemek için bir soruşturma yürütüyor. Ancak, bu pek çok isimle giden bir Siyah Örgüt üyesi olan Tooru Amuro'nun soruşturmasına müdahale etmesi zorlaşıyor.

Dedektif Conan: Sıfır Tolerans

As police inspector Yamato Kansuke pursues a certain man in the snowy mountains of Nagano, a shadow suddenly appears in his field of vision. While he's distracted, a rifle bullet fired by someone grazes his left eye and causes an avalanche accompanied by a roar.
 Ten months later, Kansuke, having miraculously survived the avalanche, receives a report that a researcher at the Nobeyama National Astronomical Observatory has been attacked.

Detective Conan: One-eyed Flashback

The words that Gold Roger, the King of the Pirates, uttered just before his death excited the masses and the world has entered a Great Pirate Era! There is a group of young pirates who are about to set sail on the Grand Line. Monkey D. Luffy, a rubber man. Roronoa Zoro aka “Pirate Hunter.” Usopp, a sniper. Sanji, a seafaring cook. And “Cat Burglar” Nami. They, the Straw Hats, all place a foot upon a barrel and make their vows before their next journey across the great ocean.