UC 0093'te Federasyon yenilgiden kurtulmuş ve isyancı güçlerle başa çıkmak için yeni bir sömürge karşıtı özel kuvvetler birimi oluşturmuştur: Londo Bell. Uzayın başka bir yerinde, Char Aznable, artık kendi Neo-Zeon hareketine komuta ettiğini ve bir kıyamet yaratarak Dünya sakinlerini uzaya göçe zorlamayı planladığını açıklayarak kendini gizlediği yerden yeniden ortaya çıkar.