Bu çağda insanlık iki alt türe dönüşmüştür: Dünya'da yaşayan Doğallar ve yörünge kolonilerinde yaşayan uzayın zorluklarına dayanabilen genetik olarak geliştirilmiş insanlar olan Koordinatörler. Hikaye, tarafsız bir uzay kolonisinin Koordinatörler tarafından işgal edilmesinin ardından iki ırk arasındaki savaşa dahil olan genç Koordinatör Kira Yamato'nun etrafında dönüyor.

Mobile Suit Gundam SEED

Bir yaz kampı sırasında 8'i erkek, 7'si kız 15 çocuk deniz kenarında bir mağara bulur. Mağaranın derinliklerinde çalışan bilgisayarlar ve bazı elektronik ekipmanlar, daha sonra da Kokopelli adında bir adam keşfederler. Kokopelli, büyük bir robotun Dünya'yı on beş uzaylı istilasına karşı savunması gereken yepyeni bir oyun üzerinde çalışan bir programcı olduğunu iddia etmektedir. Çocukları oyunu test etmeye ve bir sözleşme imzalamaya ikna eder. Biri hariç hepsi imzalar; ancak bir süre sonra gizemli bir şekilde kıyıda uyandıklarında olanların sadece bir rüya olduğuna inanırlar.

Bokurano

Orijinal Mobile Suit Gundam SEED'den iki yıl sonra, ZAFT normal insan ırkı olan Naturals'a karşı başka bir savaşa girmek üzereyken geçen dizi, ZAFT'tan bir asker olan Shinn Asuka'ya ve geri dönen çeşitli karakterlerin savaşa katılımına odaklanıyor.

Mobile Suit Gundam Seed Destiny

Karanlık fantezi, Akihito Kanbara adlı bir lise ikinci sınıfını izliyor. Çocuğun insana benzediği halde, yarısı Youmu'dur ve yaralanmaya karşı savunmasızdır çünkü çabucak iyileşebilir. Bir gün, Akihito, okulun çatısına atlamak üzere olduğu anlaşıldığında, birinci sınıf öğrencisi Mirai Kuriyama ile tanışır. Mirai, ruh dünyasının üyeleri arasında sapkın sayılan kanı manipüle edebilmesi nedeniyle izole edilmiştir. Ahihito Mirai'yi kurtardıktan sonra rahatsız edici olaylar ortaya çıkmaya başladı.