Stone (Deccal) Avrupa Birliği Başkanı olur ve iktidar koltuğunu Birleşmiş Milletler'i feshetmek ve Dünya Birliği adında tek bir dünya hükümeti kurmak için kullanır. Megiddo, kıyametin eşiğinde sallanan bir dünyaya doğru doğaüstü bir yolculuk. İncil'deki boyutlarda felaketler Dünya'yı sarsarken, Armageddon savaşı için dünya ordularını toplamaya kararlı Makyavelist bir liderin yükselişini takip ediyor. Megiddo, Omega Şifresi'nin hem öncesi hem de devamı olmasına rağmen, selefini kaçıranlar için tek başına bir hikâye olarak da işliyor. Duygusal özünde Megiddo, aynı kadına aşık olan, kardeş olarak yetiştirilen ve büyüdüklerinde kendilerini tüm dünyanın kaderi ve ruhları için birbirleriyle karşı karşıya bulan iki adamın Caine ve Abel hikayesidir.